Protein–RNA interactions for Protein: Q3LFD5

USP41, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 41, humanhuman

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Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41Q3LFD5 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
USP41Q3LFD5 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP41Q3LFD5 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP41Q3LFD5 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
USP41Q3LFD5 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
USP41Q3LFD5 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP41Q3LFD5 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP41Q3LFD5 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP41Q3LFD5 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP41Q3LFD5 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP41Q3LFD5 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP41Q3LFD5 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP41Q3LFD5 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP41Q3LFD5 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP41Q3LFD5 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP41Q3LFD5 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
USP41Q3LFD5 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP41Q3LFD5 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP41Q3LFD5 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP41Q3LFD5 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
USP41Q3LFD5 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
USP41Q3LFD5 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
USP41Q3LFD5 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
USP41Q3LFD5 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
USP41Q3LFD5 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
USP41Q3LFD5 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
USP41Q3LFD5 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
USP41Q3LFD5 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
USP41Q3LFD5 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
USP41Q3LFD5 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
USP41Q3LFD5 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
USP41Q3LFD5 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
USP41Q3LFD5 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
USP41Q3LFD5 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
USP41Q3LFD5 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
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USP41Q3LFD5 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
USP41Q3LFD5 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
USP41Q3LFD5 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
USP41Q3LFD5 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
USP41Q3LFD5 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
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USP41Q3LFD5 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
USP41Q3LFD5 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
USP41Q3LFD5 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
USP41Q3LFD5 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
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USP41Q3LFD5 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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USP41Q3LFD5 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
USP41Q3LFD5 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
USP41Q3LFD5 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
USP41Q3LFD5 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
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USP41Q3LFD5 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
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USP41Q3LFD5 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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