Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
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RTL8BQ17RB0 AC087392.1-201ENST00000576252 820 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
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