Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 ELOC-201ENST00000284811 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 VN1R96P-201ENST00000446052 858 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AC068196.1-201ENST00000456895 833 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 RPL5P16-201ENST00000471467 790 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AL035587.1-202ENST00000607218 984 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 VNN3-203ENST00000392393 1603 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms