Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 EYA4-206ENST00000431403 2154 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AC018558.5-201ENST00000565840 952 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 NBPF12-203ENST00000611443 5594 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 ARFGEF3-201ENST00000251691 14877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AF131216.1-201ENST00000498997 5856 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 IGSF6-201ENST00000268389 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 FAT2-201ENST00000261800 14534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 ETFBKMT-201ENST00000357721 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 FBXL13-208ENST00000456695 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 CEP250-202ENST00000397527 15703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 KCNMA1-203ENST00000354353 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CACNA1SQ13698 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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