Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 HCFC2P1-201ENST00000392864 1592 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 AL136455.1-201ENST00000441083 1240 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 AC068196.1-201ENST00000456895 833 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 AC112496.1-201ENST00000497961 562 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 GJA9-202ENST00000360786 1901 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms