Protein–RNA interactions for Protein: Q12951

FOXI1, Forkhead box protein I1, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI1Q12951 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 AL354989.1-201ENST00000448245 635 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 LINC01795-201ENST00000454367 813 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 CXCR6-203ENST00000457814 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 AC117395.2-201ENST00000463122 1128 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 AC009269.1-201ENST00000470368 833 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 AC107956.2-201ENST00000496042 454 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 AC122714.1-201ENST00000502510 459 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 AC116049.2-201ENST00000508572 754 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 LINC02223-203ENST00000514771 781 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 AC022973.2-201ENST00000520146 549 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 EPB41L2-209ENST00000525193 2121 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 BCAS2P1-201ENST00000528022 632 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 AC099687.1-201ENST00000531798 510 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 AC078929.1-201ENST00000547679 502 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 AC004817.1-201ENST00000553621 721 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 AC015853.3-201ENST00000570974 478 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 PPP4R1-AS1-201ENST00000582435 379 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 AC010761.6-201ENST00000587898 197 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 RN7SL760P-201ENST00000607344 270 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 AL121809.2-201ENST00000613169 341 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 AC135050.6-202ENST00000613584 392 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 uc_338.21-201ENST00000622458 147 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 SAMMSON-203ENST00000641005 2168 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 AC090771.1-201ENST00000585803 1618 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 INTS7-203ENST00000366994 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 EEF1A1P22-201ENST00000559385 1380 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 CDC73-204ENST00000635846 3987 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 LSM8-204ENST00000424702 4030 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 POT1-AS1-203ENST00000435452 2147 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 CCDC158-201ENST00000388914 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 DDX10P2-201ENST00000417796 2614 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 RRS1-AS1-201ENST00000499642 4366 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 EPHA6-204ENST00000502694 1582 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 CDY7P-201ENST00000429883 1604 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 RN7SKP211-201ENST00000363328 315 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 FABP9-201ENST00000379071 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 MIR614-201ENST00000385082 90 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 AL137058.2-203ENST00000398039 825 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 AC113608.1-201ENST00000398740 305 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 EEF1GP6-201ENST00000402309 905 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 SNRPD3-202ENST00000402849 567 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXI1Q12951 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.8 ms