Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 AL512413.1-201ENST00000606489 382 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 MRPL35-203ENST00000409180 651 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 AC064862.5-201ENST00000440618 334 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 AL356121.1-201ENST00000442911 156 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 AC004870.2-201ENST00000445615 831 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 SNRPCP11-201ENST00000492453 205 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 AC018639.1-201ENST00000492994 442 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 RBBP4P1-201ENST00000502424 1276 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 METTL23-207ENST00000588783 1184 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 AL161457.2-206ENST00000592778 802 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 SCRN1-210ENST00000631335 423 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 OR4A41P-201ENST00000533053 928 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 AL049829.2-201ENST00000554010 285 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
IFFO1Q0D2I5 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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