Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AP005901.4-201ENST00000577336 569 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms