Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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SFTPDP35247 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SFTPDP35247 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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