Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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