Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 PPWD1-201ENST00000261308 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 PPWD1-214ENST00000535264 2195 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 NNT-201ENST00000264663 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 ASAH1-267ENST00000637991 2399 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 MRE11-201ENST00000323929 6897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 ITPR1-202ENST00000354582 10242 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 CACHD1-201ENST00000290039 5275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 FBXW10-203ENST00000395665 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 ANK2-215ENST00000509550 3638 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 CPSF6-202ENST00000435070 6616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 MRPS18C-201ENST00000295491 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 RASGRP3-203ENST00000407811 4210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 PTPRG-AS1-204ENST00000474795 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC121758.1-201ENST00000557452 3942 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 GAPVD1-215ENST00000470056 8923 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 OSGEPL1-207ENST00000522700 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 CACNB4-223ENST00000636380 1756 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 SLC4A10-201ENST00000272716 3414 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 SLC15A2-205ENST00000489711 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 LY75-201ENST00000263636 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 ZSCAN5A-201ENST00000391713 3562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 BICC1-202ENST00000373886 5475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC002486.2-201ENST00000447806 590 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AL049650.1-201ENST00000461548 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC008662.1-201ENST00000521805 674 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AL845552.1-201ENST00000556820 323 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 IAPP-205ENST00000542023 2015 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 TRMT10A-202ENST00000394876 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 PBLD-204ENST00000358769 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 IFT74-204ENST00000443698 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AKAP17BP-201ENST00000431706 2719 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 ZNF160-208ENST00000599056 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 UBE2V1-201ENST00000340309 2536 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 FBXW2-205ENST00000608872 9138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 TMEM170B-201ENST00000379426 8362 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 KCNIP4-202ENST00000382148 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 ZNF699-201ENST00000308650 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.8 ms