Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AP003400.2-201ENST00000624036 666 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 LINC02342-201ENST00000627910 461 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
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