Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 LINC01773-201ENST00000437598 787 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 VN1R96P-201ENST00000446052 858 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 C5orf51-204ENST00000612065 1391 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.7 ms