Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 SYT14P1-201ENST00000481459 721 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms