Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 MAGI2-AS3-204ENST00000426835 738 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.9 ms