Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 SSX7-201ENST00000298181 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 CCR9-204ENST00000422395 1331 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 CUBNP3-201ENST00000457461 1784 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 PRLR-216ENST00000542609 1764 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 MRPS27-201ENST00000261413 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 KYNU-203ENST00000409512 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 ELMO2-203ENST00000372176 3678 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 OR52H1-201ENST00000322653 1057 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 RNA5SP512-201ENST00000364550 120 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AL359382.1-201ENST00000417838 426 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 Z82198.3-201ENST00000421145 199 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC239367.3-201ENST00000428996 814 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC096677.2-201ENST00000430471 598 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 LHFPL3-AS1-204ENST00000433514 748 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC245140.1-201ENST00000433825 341 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC234771.4-201ENST00000441416 730 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC011742.2-201ENST00000443818 352 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 RPL23AP28-201ENST00000448062 470 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC009518.1-201ENST00000452219 559 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 NPM1P9-201ENST00000453156 844 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AL096803.1-201ENST00000456921 1021 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 RN7SL216P-201ENST00000471607 298 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 PPP1R2P6-201ENST00000478565 588 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 RN7SL502P-201ENST00000481857 290 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 SNRPCP11-201ENST00000492453 205 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC098487.1-203ENST00000512915 546 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC090791.1-201ENST00000530960 492 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC022509.1-203ENST00000541940 708 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 CBX5-204ENST00000550411 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 PSMA3-AS1-206ENST00000555037 446 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 PPIAP6-201ENST00000557078 499 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC087286.3-201ENST00000561409 953 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC010266.1-201ENST00000568962 442 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC010761.3-201ENST00000578819 499 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 RN7SL66P-201ENST00000582099 264 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC010333.3-201ENST00000615100 402 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 MRPL57P3-201ENST00000619218 176 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 SNORA16A-202ENST00000628458 135 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 LINC01252-201ENST00000499291 3673 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 KIAA0895-201ENST00000297063 4153 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 EIF4ENIF1-205ENST00000397523 3420 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms