Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 AL137224.1-201ENST00000527984 389 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 CCDC58P1-201ENST00000578567 430 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 AL161457.2-206ENST00000592778 802 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 LIPF-201ENST00000238983 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 FPGT-TNNI3K-201ENST00000370893 1195 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 SCP2-207ENST00000435345 894 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 AL356121.1-201ENST00000442911 156 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 AC131094.1-201ENST00000506984 490 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
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BNIP1Q12981 PSMA4-209ENST00000559082 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
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BNIP1Q12981 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 RPL17-C18orf32-203ENST00000584895 1440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
BNIP1Q12981 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
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