Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 OR5AN1-202ENST00000641850 8468 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 PLD5-203ENST00000427495 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 KCNJ15-220ENST00000612702 3046 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 NAT1-206ENST00000518029 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 CCR9-201ENST00000355983 2653 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 PGM5-AS1-202ENST00000420855 572 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 SCARNA9-201ENST00000530422 353 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC116631.1-202ENST00000640984 683 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 ANKFN1-201ENST00000318698 2426 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 GRIK1-AS1-205ENST00000455392 767 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 CCDC158-201ENST00000388914 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC096754.1-201ENST00000508904 818 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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