Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
EPHB4P54760 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
EPHB4P54760 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
EPHB4P54760 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
EPHB4P54760 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
EPHB4P54760 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
EPHB4P54760 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
EPHB4P54760 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
EPHB4P54760 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.33
EPHB4P54760 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
EPHB4P54760 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
EPHB4P54760 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
EPHB4P54760 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
EPHB4P54760 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 OR4G1P-202ENST00000641173 1788 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
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