Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 F9-202ENST00000394090 1272 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
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PTPRCP08575 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
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PTPRCP08575 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
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PTPRCP08575 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
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PTPRCP08575 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
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