Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006455.6-201ENST00000426192 893 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM36-IT1-201ENST00000503723 881 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010531.5-201ENST00000602779 450 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 BMPR1APS2-201ENST00000527904 1012 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AF117829.2-201ENST00000619538 361 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms