Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 OR4A21P-201ENST00000532759 944 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AC008655.2-201ENST00000597049 304 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 Metazoa_SRP.106-201ENST00000622471 296 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 UBAP2-201ENST00000360802 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 A2ML1-201ENST00000299698 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AF131215.2-201ENST00000531549 1710 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 PHLDB2-202ENST00000393925 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 OLFML1-201ENST00000329293 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 LINC00922-203ENST00000569736 1760 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 CDH2-202ENST00000399380 3737 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 ADAL-202ENST00000422466 3767 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AL512624.2-201ENST00000621705 2566 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 ADGRE3-201ENST00000253673 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 UGT2B4-201ENST00000305107 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 LRP2-201ENST00000263816 15808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AGO1-201ENST00000373204 13708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 THAP9-201ENST00000302236 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 PPP3R2-201ENST00000374806 3387 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 NUDT13-206ENST00000537969 2151 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AL160408.3-201ENST00000442382 3564 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 ZNF532-224ENST00000591808 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 INTS2-201ENST00000251334 4255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 CYP4Z2P-202ENST00000505841 1436 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 CEBPZOS-204ENST00000402297 3158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AMPD3-209ENST00000529507 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 S100A1-202ENST00000368696 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 H3F3AP3-201ENST00000497682 407 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC022784.1-201ENST00000512942 699 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AL162632.2-201ENST00000553933 399 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 PPP4R1-AS1-201ENST00000582435 379 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 PTK2-207ENST00000517887 4661 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 CSNK1A1-204ENST00000504676 1772 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 MED28-201ENST00000237380 10868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 DNAJC5G-203ENST00000404433 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 FDFT1-222ENST00000538689 2289 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.5 ms