Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AC117394.1-201ENST00000477323 567 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 PCNPP2-201ENST00000441651 455 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AL157385.1-201ENST00000446973 268 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SAMD8Q96LT4 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms