Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 NFYAP1-201ENST00000431953 972 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 RPL5P16-201ENST00000471467 790 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 AC010531.5-201ENST00000602779 450 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
C17orf47Q8NEP4 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms