Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 LINC01013-205ENST00000458028 1345 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AC099535.1-201ENST00000408928 371 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 PPIA-203ENST00000451562 544 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 SAMD3-205ENST00000457563 1877 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
IMPG1Q17R60 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
IMPG1Q17R60 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
IMPG1Q17R60 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
IMPG1Q17R60 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
IMPG1Q17R60 CXADRP1-201ENST00000398098 1095 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
IMPG1Q17R60 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
IMPG1Q17R60 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
IMPG1Q17R60 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
IMPG1Q17R60 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
IMPG1Q17R60 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
IMPG1Q17R60 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
IMPG1Q17R60 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
IMPG1Q17R60 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
IMPG1Q17R60 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
IMPG1Q17R60 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
IMPG1Q17R60 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
IMPG1Q17R60 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
IMPG1Q17R60 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
IMPG1Q17R60 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
IMPG1Q17R60 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
IMPG1Q17R60 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
IMPG1Q17R60 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
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