Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 ALDH7A1P4-201ENST00000412255 178 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 SNX18P13-201ENST00000412442 529 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 AC118470.1-201ENST00000419891 453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 EIF4A1P5-201ENST00000428062 1095 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 CR391992.1-201ENST00000438601 394 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 AC019185.3-201ENST00000438805 323 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 MYL6P4-201ENST00000477911 453 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 AC226119.1-201ENST00000514073 682 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 AC087277.1-201ENST00000529910 535 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 OR5M6P-201ENST00000530227 937 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 AP001257.1-201ENST00000533106 385 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 ASB8-207ENST00000536953 923 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 AL132640.1-201ENST00000559594 619 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 C16orf62-224ENST00000567245 573 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 MIR4685-201ENST00000578185 69 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 RN7SL778P-201ENST00000607160 297 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 AC061709.1-202ENST00000615029 527 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 Metazoa_SRP.129-201ENST00000619776 251 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 AC018558.4-201ENST00000622153 281 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 AP000577.1-201ENST00000624366 878 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 GCNT2-218ENST00000640968 939 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 TBC1D32-201ENST00000275159 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
FXNQ16595 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
FXNQ16595 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
FXNQ16595 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FXNQ16595 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
FXNQ16595 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FXNQ16595 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
FXNQ16595 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FXNQ16595 CASP10-208ENST00000448480 1603 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
FXNQ16595 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
FXNQ16595 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
FXNQ16595 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
FXNQ16595 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FXNQ16595 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FXNQ16595 TPRG1-204ENST00000433971 2296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FXNQ16595 SNORA70.3-201ENST00000365075 132 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FXNQ16595 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FXNQ16595 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FXNQ16595 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FXNQ16595 AC090114.1-201ENST00000393266 448 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FXNQ16595 MTIF3-203ENST00000405591 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
FXNQ16595 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FXNQ16595 PPIAP30-201ENST00000415473 519 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FXNQ16595 AL360013.1-201ENST00000419031 858 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FXNQ16595 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FXNQ16595 AL357314.1-201ENST00000433521 806 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FXNQ16595 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FXNQ16595 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FXNQ16595 AL445623.1-201ENST00000440888 237 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FXNQ16595 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FXNQ16595 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
FXNQ16595 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FXNQ16595 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FXNQ16595 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms