Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
USF2Q15853 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
USF2Q15853 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
USF2Q15853 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
USF2Q15853 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
USF2Q15853 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
USF2Q15853 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
USF2Q15853 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
USF2Q15853 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
USF2Q15853 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
USF2Q15853 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
USF2Q15853 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
USF2Q15853 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
USF2Q15853 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
USF2Q15853 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
USF2Q15853 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
USF2Q15853 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
USF2Q15853 SNORA11.5-201ENST00000408163 128 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
USF2Q15853 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
USF2Q15853 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
USF2Q15853 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
USF2Q15853 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
USF2Q15853 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
USF2Q15853 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
USF2Q15853 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
USF2Q15853 OR52E7P-201ENST00000452394 933 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
USF2Q15853 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
USF2Q15853 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC122718.2-201ENST00000505325 591 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
USF2Q15853 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
USF2Q15853 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
USF2Q15853 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
USF2Q15853 OR4A41P-201ENST00000533053 928 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC084880.3-201ENST00000535921 541 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
USF2Q15853 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
USF2Q15853 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
USF2Q15853 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC005828.7-201ENST00000607331 556 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
USF2Q15853 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
USF2Q15853 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
USF2Q15853 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
USF2Q15853 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
USF2Q15853 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
USF2Q15853 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
USF2Q15853 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
USF2Q15853 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
USF2Q15853 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
USF2Q15853 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
USF2Q15853 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
USF2Q15853 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
USF2Q15853 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
USF2Q15853 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
USF2Q15853 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
USF2Q15853 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
USF2Q15853 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
USF2Q15853 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
USF2Q15853 RBBP4P5-201ENST00000398583 1266 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
USF2Q15853 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
USF2Q15853 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
USF2Q15853 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
USF2Q15853 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
USF2Q15853 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC117394.1-201ENST00000477323 567 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
USF2Q15853 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
USF2Q15853 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
USF2Q15853 LINC01477-201ENST00000566101 1226 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC011468.3-201ENST00000597886 332 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
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