Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
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SS18Q15532 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
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SS18Q15532 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
SS18Q15532 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SS18Q15532 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
SS18Q15532 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SS18Q15532 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
SS18Q15532 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SS18Q15532 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
SS18Q15532 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.81
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