Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC015819.1-201ENST00000613588 663 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC004801.6-201ENST00000616571 978 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC009965.1-201ENST00000411436 570 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 KCTD9P1-201ENST00000430462 1167 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AL513348.1-201ENST00000435554 440 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 PA2G4P1-201ENST00000442248 1197 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 ATP5G2-205ENST00000549748 728 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 UEVLD-202ENST00000320750 1799 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AP000755.1-201ENST00000527100 507 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
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