Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AL031651.1-201ENST00000615357 1438 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 ENTPD1-205ENST00000453258 5044 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC104162.1-201ENST00000430831 2382 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 IL2RA-203ENST00000379959 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AL669831.5-205ENST00000429505 441 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 GTF2IP14-201ENST00000441415 586 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 VN1R38P-201ENST00000450265 887 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 CCNJP2-201ENST00000457810 1163 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC106822.1-201ENST00000502647 526 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC244034.2-201ENST00000562504 509 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AP002345.2-201ENST00000609961 904 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 CYP2G2P-201ENST00000594920 1485 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 ADAMTS9-AS2-203ENST00000481312 1970 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 PRRC1-204ENST00000512635 2726 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms