Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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ZNF548Q8NEK5 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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ZNF548Q8NEK5 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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ZNF548Q8NEK5 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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ZNF548Q8NEK5 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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ZNF548Q8NEK5 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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ZNF548Q8NEK5 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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ZNF548Q8NEK5 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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ZNF548Q8NEK5 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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ZNF548Q8NEK5 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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ZNF548Q8NEK5 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 OR7A10-202ENST00000641129 1847 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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