Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC005229.3-201ENST00000603438 323 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC012594.1-271ENST00000438635 736 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 LINC02342-201ENST00000627910 461 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 SYT14P1-202ENST00000600441 1448 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
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