Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
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TCIRG1Q13488 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AL355922.5-201ENST00000553534 351 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
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TCIRG1Q13488 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
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TCIRG1Q13488 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
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TCIRG1Q13488 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
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TCIRG1Q13488 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
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TCIRG1Q13488 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
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