Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 TNR-IT1-201ENST00000455447 630 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 RPLP0P1-201ENST00000457002 361 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 RN7SL418P-201ENST00000473031 287 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 RPS23-208ENST00000512493 443 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 RNA5SP101-201ENST00000517036 108 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AP005902.2-201ENST00000518393 307 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AC015468.2-201ENST00000519605 550 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 FOLH1B-202ENST00000529567 2145 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AC021483.1-201ENST00000560760 539 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 OR1P1-201ENST00000571766 994 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AC024614.1-201ENST00000577546 307 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 MIR8082-201ENST00000612488 81 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AC135050.6-202ENST00000613584 392 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 LINC01125-248ENST00000627284 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 SPRR5-201ENST00000636302 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AC013470.2-202ENST00000635746 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 DCAF6-202ENST00000367840 3349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 ATP1A2-202ENST00000392233 3338 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 TMEM236-201ENST00000377495 5464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 PLEKHG1-201ENST00000358517 7138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 ZNF708-201ENST00000356929 4004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 NUTM1-203ENST00000537011 4102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 MAT1A-201ENST00000372213 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 MAGI2-214ENST00000628781 2013 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 ERG-210ENST00000442448 5034 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 DEUP1-209ENST00000531792 1656 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 TBCK-201ENST00000273980 8101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 KIF23-201ENST00000260363 3713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 LINC02102-201ENST00000503989 3364 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 FPR3-202ENST00000595991 2222 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 TMPPE-202ENST00000416695 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 SCMH1-205ENST00000372595 3231 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 SOCS6-203ENST00000582322 2625 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 MXI1-203ENST00000361248 2188 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 RBM5-201ENST00000347869 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 SLC11A2-203ENST00000394904 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 PSG3-204ENST00000595140 1724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 SSX6-201ENST00000376932 562 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 TRAV12-1-201ENST00000390433 340 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 FTH1P3-201ENST00000394290 584 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 LINC00354-201ENST00000412119 347 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AC009228.1-201ENST00000413254 240 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AC068481.1-201ENST00000415520 530 ntTSL 4 BASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AL713965.1-201ENST00000421166 230 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 PHB2P1-201ENST00000434943 890 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 FOXP1-AS1-201ENST00000465742 700 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AC087379.2-201ENST00000532242 471 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AL355102.4-201ENST00000553638 738 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AC010327.2-201ENST00000587647 488 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 RPL23AP77-201ENST00000588044 463 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AL589765.5-201ENST00000596133 515 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AC068631.1-229ENST00000599314 739 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AL390058.1-201ENST00000603834 629 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AC069499.2-201ENST00000610665 382 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 LINC00923-204ENST00000614972 1181 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AC244153.1-204ENST00000615582 401 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AL121985.2-201ENST00000621192 555 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 MIR6813-201ENST00000621638 56 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
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