Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AL139350.1-201ENST00000448825 408 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TMPOP42166 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TMPOP42166 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TMPOP42166 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TMPOP42166 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TMPOP42166 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TMPOP42166 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TMPOP42166 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TMPOP42166 NPM1P45-201ENST00000583151 559 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TMPOP42166 LINC01862-201ENST00000593792 478 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TMPOP42166 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TMPOP42166 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TMPOP42166 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TMPOP42166 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TMPOP42166 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TMPOP42166 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
TMPOP42166 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TMPOP42166 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
TMPOP42166 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TMPOP42166 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TMPOP42166 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
TMPOP42166 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
TMPOP42166 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
TMPOP42166 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TMPOP42166 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
TMPOP42166 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TMPOP42166 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TMPOP42166 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
TMPOP42166 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TMPOP42166 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
TMPOP42166 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
TMPOP42166 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TMPOP42166 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
TMPOP42166 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
TMPOP42166 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
TMPOP42166 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TMPOP42166 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TMPOP42166 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TMPOP42166 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TMPOP42166 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TMPOP42166 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TMPOP42166 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TMPOP42166 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TMPOP42166 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TMPOP42166 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TMPOP42166 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TMPOP42166 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TMPOP42166 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TMPOP42166 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TMPOP42166 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TMPOP42166 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TMPOP42166 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TMPOP42166 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TMPOP42166 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TMPOP42166 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TMPOP42166 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TMPOP42166 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TMPOP42166 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TMPOP42166 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
TMPOP42166 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
TMPOP42166 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
TMPOP42166 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
TMPOP42166 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
TMPOP42166 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
TMPOP42166 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TMPOP42166 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TMPOP42166 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
TMPOP42166 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TMPOP42166 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
TMPOP42166 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TMPOP42166 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TMPOP42166 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TMPOP42166 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TMPOP42166 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TMPOP42166 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TMPOP42166 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TMPOP42166 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TMPOP42166 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TMPOP42166 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TMPOP42166 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TMPOP42166 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TMPOP42166 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TMPOP42166 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TMPOP42166 BMPR1APS2-201ENST00000527904 1012 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TMPOP42166 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TMPOP42166 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TMPOP42166 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TMPOP42166 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TMPOP42166 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TMPOP42166 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TMPOP42166 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TMPOP42166 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
TMPOP42166 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
TMPOP42166 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
TMPOP42166 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
TMPOP42166 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
TMPOP42166 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
TMPOP42166 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
TMPOP42166 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TMPOP42166 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms