Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SFTPDP35247 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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