Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 PGAP1-201ENST00000354764 11114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 ITSN1-206ENST00000381318 17015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 DCSTAMP-201ENST00000297581 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 MAPK10-383ENST00000642032 3390 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 KAT6B-203ENST00000372714 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 ASB4-202ENST00000325885 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 MAGT1-201ENST00000358075 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 MDM4-214ENST00000612738 9407 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 MRO-201ENST00000256425 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 ACSL5-201ENST00000354273 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 MMS22L-201ENST00000275053 8643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 NOS1-206ENST00000618760 12283 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 ABI1-207ENST00000376142 3576 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 SLF2-202ENST00000370269 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC107884.1-202ENST00000622955 2703 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC016831.1-201ENST00000432045 6411 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 MKKS-201ENST00000347364 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 VTI1A-201ENST00000393077 4131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 NOSTRIN-202ENST00000397206 1446 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC018467.1-202ENST00000432612 533 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 LINC02059-201ENST00000503843 452 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC083906.1-201ENST00000509298 406 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 ZFP2-202ENST00000520301 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 PLA2G7-202ENST00000537365 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 TMC5-206ENST00000561503 2487 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC099511.1-201ENST00000564561 590 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 OR1N1-202ENST00000619659 939 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC096582.3-201ENST00000636578 3716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 TEKT1-201ENST00000338694 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 NIN-204ENST00000382043 4216 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 ERLIN2-201ENST00000276461 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 VTCN1-207ENST00000539893 2719 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 UG0898H09-202ENST00000623646 7040 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 KMT2A-213ENST00000534358 16602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.5 ms