Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AL357568.1-201ENST00000421530 1963 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 OSBPL6-207ENST00000409631 3273 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
USP18Q9UMW8 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
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