Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 SLC35F5-213ENST00000638402 1554 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AC020978.7-201ENST00000575953 1187 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 MTCO1P8-201ENST00000416914 1523 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms