Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX2

KCTD12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD12Q96CX2 SNORA77.1-201ENST00000408156 125 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 RPL21P107-201ENST00000411449 460 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 STPG3-202ENST00000412566 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 AC007384.1-202ENST00000417026 891 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 AC005006.1-201ENST00000432130 249 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 LINC01723-201ENST00000432244 601 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 AKR1C3-202ENST00000439082 972 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 AL096701.1-201ENST00000445477 457 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 AC022400.2-201ENST00000446730 866 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 C15orf40-202ENST00000451195 518 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 AC006455.3-201ENST00000454641 333 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 RN7SL567P-201ENST00000462015 303 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 RN7SL120P-201ENST00000463924 296 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 RN7SL63P-201ENST00000468228 304 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 RN7SL252P-201ENST00000496274 297 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 ZBED5-AS1-201ENST00000501079 1071 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 LYNX1-207ENST00000523332 600 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 FDPSP4-201ENST00000534629 1049 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 AC004858.1-201ENST00000554078 242 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 AC090607.2-201ENST00000560331 695 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 GLUD1P2-201ENST00000583339 201 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 RN7SL44P-201ENST00000583849 302 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 GLUD1P8-201ENST00000585063 203 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 TBX18-AS1-208ENST00000591225 762 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 MTND6P22-201ENST00000604233 521 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 YTHDF2P1-201ENST00000604759 1271 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 WT1-AS_1.1-201ENST00000619639 109 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 STPG3-205ENST00000620243 1025 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 AC001226.1-201ENST00000620512 539 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 MCM3AP-AS1-201ENST00000414659 2539 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 ENAH-209ENST00000635051 3308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 TAPT1-AS1-201ENST00000570786 2165 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 KCNN3-201ENST00000271915 13033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 HINFP-201ENST00000350777 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 DCN-220ENST00000552962 1930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 DHX32-202ENST00000368721 2389 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 ERBB4-205ENST00000436443 12084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 ZNF415-213ENST00000597503 2469 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 GABPB2-202ENST00000368918 8964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 XPO1-203ENST00000406957 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 KIAA1217-202ENST00000376451 7383 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 AC009690.2-201ENST00000570175 3148 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 COLGALT2-202ENST00000367520 2325 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 REG4-203ENST00000369401 2327 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 UTY-202ENST00000331397 6529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 SLC37A3-202ENST00000340308 2955 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 KDM5A-201ENST00000399788 10763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 ZBED3-AS1-216ENST00000515356 1987 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 C2orf91-201ENST00000378711 3721 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 LINC02367-201ENST00000567749 4388 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 KIAA1217-201ENST00000307544 3281 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 CD46-205ENST00000358170 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 WIPF3-203ENST00000409290 4002 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 ALG13-201ENST00000251943 3997 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 ART4-201ENST00000228936 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 ZNF670-ZNF695-202ENST00000474541 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 TPPP2-201ENST00000321760 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 PDE4DIP-203ENST00000369349 4677 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 CYP17A1-AS1-201ENST00000369884 491 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 FTH1P3-201ENST00000394290 584 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 AL034417.1-201ENST00000399343 800 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 AC005999.1-201ENST00000414409 588 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 RPL12P27-201ENST00000414870 496 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 FAM133B-202ENST00000427372 931 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 AC009988.1-201ENST00000434988 310 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 AC104088.1-201ENST00000445613 510 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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