Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 AC040173.1-201ENST00000572479 580 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 CXADRP3-202ENST00000617265 1100 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 AL157385.1-201ENST00000446973 268 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 RNU2-18P-201ENST00000411224 162 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 LINC01487-201ENST00000462531 905 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.4 ms