Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 ZAN-205ENST00000613979 8669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 MEF2C-210ENST00000506554 3469 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC007614.5-201ENST00000623424 8892 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 MYO5A-213ENST00000613858 12139 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 ENAH-209ENST00000635051 3308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 GPR161-210ENST00000546300 7388 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 STAMBPL1-201ENST00000371922 1899 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 HSBP1-201ENST00000433866 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 SORBS1-210ENST00000371246 6931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 ZNF225-201ENST00000262894 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 KLHL32-207ENST00000620278 2642 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 TRIM44-201ENST00000299413 12964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 ATAD2B-201ENST00000238789 8103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 FOXP1-212ENST00000491238 2250 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 CDON-201ENST00000263577 4186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 NPL-201ENST00000258317 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 FAM135B-204ENST00000395297 6962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 TNFSF15-202ENST00000374045 6687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 NEDD9-216ENST00000620854 4086 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 GPBP1-203ENST00000424459 4683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AP002364.1-201ENST00000623330 3386 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 BTAF1-201ENST00000265990 7250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 CFLAR-201ENST00000309955 14672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 EYA3-208ENST00000540618 5885 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 INPP5F-208ENST00000637174 3168 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 CCPG1-201ENST00000310958 6822 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 SON-201ENST00000300278 7477 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC006441.1-201ENST00000581083 437 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 SPHKAP-202ENST00000392056 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 TMCC1-203ENST00000432054 5631 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 EIF4E3-204ENST00000425534 9949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 ZNF181-204ENST00000492450 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 PAPPA2-202ENST00000367662 9691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.8 ms