Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 LINC02352-202ENST00000559292 1450 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AC007386.1-201ENST00000455212 582 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms