Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 OR51A1P-201ENST00000511110 946 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AC008073.2-201ENST00000428344 792 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 LINC02217-201ENST00000505844 687 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
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SIX1Q15475 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
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SIX1Q15475 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
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SIX1Q15475 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
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SIX1Q15475 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
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SIX1Q15475 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
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SIX1Q15475 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
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SIX1Q15475 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 DNAJC10-209ENST00000613960 1010 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
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