Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 STXBP5-201ENST00000321680 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 CYP2C8-201ENST00000371270 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 LINC02466-201ENST00000500092 1963 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 AL627309.5-201ENST00000484859 4860 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC8.62□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 ZHX3-201ENST00000309060 10030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 OR5AN1-202ENST00000641850 8468 ntAPPRIS P1 BASIC8.61□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC8.61□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC8.61□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC8.61□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC8.61□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 ETFBKMT-201ENST00000357721 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 Metazoa_SRP.55-201ENST00000618452 275 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 ZNF969P-201ENST00000510345 2341 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 KCNMB2-204ENST00000432997 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
GAPVD1Q14C86 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
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