Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 RNU1-24P-201ENST00000364285 165 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC018467.1-202ENST00000432612 533 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 SUMO2P19-201ENST00000518920 295 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 DIS3-201ENST00000377767 10604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 KCNJ1-205ENST00000392666 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 CTNND1-218ENST00000528232 5745 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 CTNND1-223ENST00000529986 5727 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 CARF-202ENST00000402905 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC007998.4-201ENST00000612496 2533 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 STAG1-202ENST00000383202 6055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 FRMD5-211ENST00000618556 5059 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 GPRIN3-201ENST00000333209 6260 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 MC4R-201ENST00000299766 1666 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 MCTP2-208ENST00000557742 1957 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 RRS1-AS1-201ENST00000499642 4366 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 UNC79-202ENST00000393151 7908 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 ZNF507-203ENST00000544431 5764 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 TMEFF2-203ENST00000409056 3364 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AP002364.1-201ENST00000623330 3386 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC026316.3-201ENST00000497988 3097 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 LCP1-202ENST00000398576 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC011742.2-201ENST00000443818 352 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC073862.4-201ENST00000622982 854 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
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