Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 TMEM246-203ENST00000374851 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 HYDIN-206ENST00000393567 15719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 TNFRSF9-204ENST00000615230 5970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 SLC23A2-202ENST00000379333 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 UNC5D-206ENST00000453357 7002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AC023283.1-201ENST00000453491 4897 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 CD109-201ENST00000287097 9130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AL079307.1-201ENST00000553312 5982 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 KAT6A-201ENST00000265713 9153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 VANGL1-204ENST00000369510 8647 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 ZNF100-202ENST00000358296 5745 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 NCR3LG1-201ENST00000338965 6438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 TRPM8-201ENST00000324695 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AP005131.1-201ENST00000585366 4745 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 INTS7-203ENST00000366994 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 MR1-208ENST00000614012 7860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 ATM-201ENST00000278616 13147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 IL16-204ENST00000394660 9616 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 ZFX-204ENST00000379188 7513 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 ATP10B-202ENST00000327245 7566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AC026688.1-201ENST00000520639 1168 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 ADGRL3-204ENST00000506720 4962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 NAIP-204ENST00000503719 5347 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 LINC02352-202ENST00000559292 1450 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 OR2J2-203ENST00000641417 2392 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
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