Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 SLC25A40-201ENST00000341119 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 SLC13A1-204ENST00000539873 2222 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AL157884.1-201ENST00000424561 454 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AL157400.1-201ENST00000428166 368 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 Z68868.1-201ENST00000429048 544 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 LAMTOR5-AS1-201ENST00000444238 881 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC092375.1-201ENST00000550410 637 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 RGS4-203ENST00000367909 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 ITPR1-204ENST00000443694 9513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AL136317.2-201ENST00000619851 2254 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 NR5A2-206ENST00000544748 4775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC007485.2-201ENST00000623493 1667 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 PPWD1-214ENST00000535264 2195 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC009831.5-201ENST00000624000 3189 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 TRG-AS1-201ENST00000629357 3645 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 C11orf54-202ENST00000354421 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 POC1B-AS1-201ENST00000605233 8041 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 ZNF521-214ENST00000584787 4327 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 KIF14-202ENST00000614960 6838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 SLC12A6-201ENST00000290209 7286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 PHLDB2-201ENST00000393923 5673 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 VTA1-202ENST00000367630 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 NRCAM-201ENST00000351718 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 SNORA81.2-201ENST00000516868 170 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.1 ms