Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 AC013283.1-201ENST00000557282 492 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC018767.3-201ENST00000564185 481 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 RAB27A-205ENST00000564609 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 WBP1LP12-201ENST00000604449 331 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AL590032.1-201ENST00000604920 252 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 TRG-AS1-201ENST00000629357 3645 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 VTCN1-203ENST00000369458 2612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 FAM111B-201ENST00000343597 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 HYDIN-215ENST00000541601 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 DTHD1-206ENST00000639862 3819 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 MAPK10-365ENST00000641902 3825 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 CCR9-204ENST00000422395 1331 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 TTLL4-210ENST00000442769 3971 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 ZNF699-201ENST00000308650 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 CLUL1-201ENST00000338387 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 GDF9-202ENST00000378673 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 CATSPER2-202ENST00000381761 1758 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 ZNF806-201ENST00000438300 1774 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 DACH2-207ENST00000510272 1764 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 DEUP1-209ENST00000531792 1656 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 RIPOR2-207ENST00000540914 3614 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 FCGR1B-210ENST00000623603 1581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 LINC01903-201ENST00000580659 2149 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC019117.1-201ENST00000636929 1462 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC011008.2-201ENST00000624866 3352 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 MGST2-201ENST00000265498 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 IFNK-201ENST00000276943 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 PIH1D3-201ENST00000336387 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 UBBP1-201ENST00000392399 473 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AP004243.1-202ENST00000398983 969 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
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HOXA3O43365 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
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HOXA3O43365 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
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HOXA3O43365 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 PFN1P11-201ENST00000445829 389 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
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HOXA3O43365 LIX1L-AS1-206ENST00000447686 846 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 RPL23AP28-201ENST00000448062 470 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 RPL5P14-201ENST00000494197 878 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 PFN2-217ENST00000498307 556 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 AC023818.1-201ENST00000498379 384 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXA3O43365 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
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