Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AP005901.4-201ENST00000577336 569 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL5P16-201ENST00000471467 790 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01587-204ENST00000623565 873 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.3 ms